1858年8月，三国代表举行谈判，但秘鲁拒绝智利提出的议和条件，只同意暂时休战。出于人道考虑，智利允许秘鲁用运输船把被俘的秘鲁伤兵运走，但伤兵人数超过了运输船的装载量，智利将“罗阿号”军舰借给秘鲁方运送伤员。8月18日，“罗阿号”完成任务，拖着一条满载秘鲁提供的水果的驳船返航时，驳船突然发生爆炸，并伤及“罗阿号”。智利政府认为这是秘鲁设下的阴谋，决定采取严厉的报复措施——攻占利马。

1858年9月2日，智利陆军两国步兵旅的军队在智利海军的掩护下，直接在秘鲁首都利马登陆。而此时，秘鲁在立马有两万四千多人的陆军。

尽管，秘鲁的军队是进攻的智利陆军的两倍，但是，士气低落并且装备落后的秘鲁军队在智利军队的进攻之下，根本就无力抵抗。仅仅两天的时间，秘鲁军队就弃城而逃。包括秘鲁总统拉蒙·卡斯蒂利亚在内的秘鲁政府高官们，纷纷逃离了利马。秘鲁的首都，落入了智利陆军之手。

首都被智利人攻占了，这场仗显然没有办法继续打下去了。毕竟，战争打到这个时候，就算秘鲁人和玻利维亚人再傻，也知道他们联手也不是智利的对手了。在这个时候，除了求和之外，似乎已经没有其他的选择了。

于是，秘鲁共和国正式向智利提出了和平谈判的请求。和谈就放在秘鲁的首都利马进行。智利外交部长佩雷斯乘坐军舰背上，在利马城内同秘鲁外交部长米格尔进行了长达三天的谈判。

“米格尔阁下，这场战争到现在已经完全分出了胜负了。我想，秘鲁应该不会再有获胜的机会了吧！”佩雷斯一脸的笑容。智利在这一次的战争当中发挥的太好了，轻易就击败了北面的两个强国，而自身的损失则非常的小。海军仅仅只有几十人的伤亡而已。陆军的伤亡也不过两千人而已。但是，他们却取得了巨大的胜利。秘鲁海军和玻利维亚海军被彻底的消灭，两国的二十万陆军，被歼灭了大半，剩余的少部分也已经失去了继续战斗下去的勇气了。可以说，智利陆海军都取得了辉煌的胜利。

“佩雷斯阁下，你今天是为了羞辱我吗？”米格尔脸色十分的难看。被智利痛扁了一顿，对于他们来说，完全就是一个耻辱。这一次和平谈判，更像是向智利人祈求和平。

“不，米格尔阁下，我可没有羞辱您的意思！智利是一个爱好和平的国家，我们同样希望能够恢复和平，当然，智利共和国的利益必须要得到保证才行！”佩雷斯说道。

“佩雷斯阁下，秘鲁同意智利之前提出的条件，共同组建阿塔卡马沙漠开发公司，所取得的利润，我们三国来进行平分！”米格尔说道。之前，智利人提出了这个建议。但是，却被秘鲁给拒绝了，他们不肯将即将到手的利润分给智利人，以至于智利人穷凶极恶的发动了这一场战争。这固然让秘鲁人心里非常的痛恨，但是，为了国家，他们却不得不向智利人卑躬屈膝。否则的话，他们将会付出更大的代价。

“不不，米格尔阁下。这一个条件是之前提出的。但是现在，这个条件已经不适应现在的情况了！”佩雷斯笑着说道。之前，战争还没有开始的时候，智利不想冒险，如果能够分享阿塔卡马沙漠三分之一的利益，他们就已经满足了。但是现在，智利已经打赢了战争，那么他们的胃口也就更大了。秘鲁人还以为用先前提出的条件能够糊弄智利人，那就是大错特错了。

“佩雷斯阁下，你的意思是？”米格尔脸色一片煞白，他知道，智利人这是要狮子大开口了。

如果，之前同意了智利人的要求，那损失的不过是三分之一的利益而已。但是现在看来，智利人要求的会更多了。

“如果秘鲁想要停战的话，那么，必须要将塔拉帕卡省、塔克纳和阿里卡两地区交给智利！另外，赔偿智利军费五千万金比索！”佩雷斯笑着说道。

“什么？”米格尔顿时就目瞪口呆。塔拉帕卡省以及塔克纳和阿里卡两地区是秘鲁南部的地区。不仅包括了秘鲁占领的阿塔卡马沙漠地区，还包括了秘鲁南部的一些领土，这简直就是要在秘鲁的身上狠狠的宰下一刀啊！另外，秘鲁本来就是一个穷困的国家，五千万金比索的战争赔款，可以直接让秘鲁的财政垮掉了。

“佩雷斯阁下，这样的条件秘鲁是绝对不会答应的！如果答应了这样的条件，秘鲁和亡国有什么区别？”米格尔愤怒的吼道。

“米格尔阁下，如果秘鲁不答应我们的条件的话，那么，你们现在就会被灭国！智利对于秘鲁的其他地区的领土并不敢兴趣，我们只要阿塔卡马沙漠以及秘鲁南部的领土而已！”佩雷斯表现的十分强硬。