噶尔丹夺得准噶尔统治权后，积极向外扩张，先后击败和硕特部，迫使固始汗出走青海。固始汗在血山之战中，用一万精兵歼灭了，喀尔喀却图汗派来支援藏巴汗的三万骑兵。

随后，固始汗大发神威，又打败了兵力占优势的藏巴汗和白利土司。从而漠西蒙古卫拉特联盟的长期盟主和硕特部，控制了整个雪域。直到雍正用年大将军收复青海为止。

噶尔丹驱逐固始汗后，统一了卫拉特联盟。随后征服哈萨克汗国、灭叶尔羌汗国，称雄西域。

1688年（康熙二十七年），准噶尔汗国的国土面积，达到了四百万平方公里。噶尔丹在野心膨胀下，开始进攻喀尔喀蒙古，土谢图汗部等喀尔喀三部被占领。

噶尔丹基本控制了外蒙古和内蒙古，东蒙古诸部惊恐逃亡辽东。噶尔丹大军直抵承德北边三百里远的乌兰布统草原，威逼北京。并随时准备出兵辽东。

在蒙古即将完全统一，辽东龙兴故地即将不保的紧要关头。康熙被迫发动三征噶尔丹之役。

1697年（康熙三十六年），康熙第三次征讨噶尔丹时，噶尔丹死于科布多。

康熙顶着巨大压力出征时，当时的形势和左宗棠出征西域之前，和李鸿章对海防和塞防之争中，所说的一样。

新疆不复，则蒙古不保。蒙古不保，则满洲不复为我所有。满洲若失，则长城以北领土尽失。京城郊外顿时成为边境之地。

噶尔丹出身比较特殊。人生也比较传奇。

七世萨温大师和他的父母关系密切，往来甚密。大师圆寂前做了很多工作，最后雪域那边认定，刚出生的巴图尔珲台吉第六子噶尔丹，为转世八世萨温大师。

他自幼有奇才，本来巴图尔珲台吉想立他为世子的。但是他以有哥哥为由，推辞了。让出准噶尔部继承人后，他先是去北京朝觐了顺治皇帝。又跑到张家口，以八世萨温大师的身份拜了五世最高大师为老师。

之后，他一直在雪域圣城修行，并且拥有自己的萨温寺庙和很多的徒众。他在雪域圣城附近，拥有很多的财产和土地，以及农奴。